В структуру института входят:
1. администрация института
2. бухгалтерского учета и отчетности
3. отдел ландшафтного земледелия
4. отдел животноводства и ветеринарной медицины
5. отдел селекции и семеноводства
6. лаборатория растениеводства
7. лаборатория овощеводства
8. лаборатория виноградарства
9. лаборатория садоводства
10. хозяйственный отдел